Е.Л. Иванова, А.С. Сарсенбаева, Д.С. Сташкевич, Н.З. Жамалдинова
Южно-Уральский государственный медицинский университет, г. Челябинск
Челябинский государственный университет
Иванова Екатерина Леонидовна
ассистент кафедры госпитальной терапии №1Южно-Уральского государственного медицинского университета
454048, г. Челябинск, ул. Блюхера, д.5а, кв. 40, тел. 8-963-475-20-88, e-mail: kate-future@mail.ru
Проведен анализ распределения аллелей и генотипов генов IL-1Ra, IL-1b, IL-4, TNFa у больных синдромом раздраженного кишечника с различными степенями дисбактериоза. Носительство гетерозиготного генотипа G/A -308 TNFα способствует развитию глубоких микробиологических нарушений в микрофлоре кишечника у больных синдромом раздраженного кишечника.
Ключевые слова: синдром раздраженного кишечника, дисбактериоз, полиморфизм генов цитокинов.
E.L. Ivanova, A.S. Sarsenbayeva, D.S. Stashkevich, N.Z. Zhamaldinova
South Ural State Medical University, Chelyabinsk
Chelyabinsk State University
CytokinegenepolymorphismofIL-1Ra, IL-1b, IL-4, TNFaandchangingintestinalmicrobialspectrumofpatientswithirritablebowelsyndrome
The analysis of the distribution of genotypes and alleles of genes IL-1Ra, IL-1b, IL-4, TNFa in patients with irritable bowel syndrome with varying degrees of dysbiosis is carried out. The carriage of the heterozygous genotype G / A -308 TNFα contributes to the development of deep disorders in the state of microbiological flora of the colon in patients with irritable bowel syndrome.
Key words: irritable bowel syndrome, dysbacteriosis, cytokine gene polymorphisms.
Синдром раздраженного кишечника (СРК) входит в группу заболеваний, относящихся к функциональной патологии желудочно-кишечного тракта. СРК в настоящее время рассматривается как результат взаимодействия важных биологических и психосоциальных факторов. Долгое время первичное нарушение двигательной функции кишечника рассматривалось в качестве патофизиологической основы СРК, однако выявить специфичные для СРК нарушения моторики не удалось. В настоящее время общепринятой является гипотеза о том, что СРК развивается не в результате нарушения кишечной моторики, а отражает расстройство регуляции между центральной нервной системой и автономной энтеральной нервной системой. По предположению В.Т. Ивашкина и А.А. Шептулина СРК развивается при наличии у личности генетической предрасположенности и воздействии сенсибилизирующего фактора. В определенной социальной среде складывается определенный психологический тип, у которого происходит сбой в регуляции функций желудочно-кишечного тракта, нарушается висцеральная чувствительность и моторика кишечника [3].
Сегодняшние представления о патофизиологии СРК позволяют предположить, что в основе запуска или усиления патологического процесса лежит комбинация факторов – недостаточная или избыточная активация иммунной системы и дисбиоз кишечника.
Участие цитокинов в патофизиологических процессах при СРК подтверждают данные лабораторных исследований в виде снижения экспрессии иммунорегуляторных цитокинов и повышения экспрессии провоспалительных цитокинов [7].
В связи с тем, что продукция цитокинов находится под генетическим контролем, можно предположить, что генетические полиморфизмы определенных цитокинов могут выступать в качестве факторов, определяющих чувствительность индивида к развитию СРК и влияющих на вариабельность клинических проявлений заболевания.
В ряде работ установлены особенности распределения полиморфизма генов цитокинов у больных СРК по сравнению с практически здоровыми лицами [1], а также ассоциация VNTR полиморфизма в гене IL-1Ra с клинико-морфологическими вариантами, психопатологическими расстройствами у больных СРК [2].
Цель исследования − провести анализ распределения полиморфизма генов цитокинов IL-1Ra, IL-1b, IL-4, TNFaу больных СРК, установить характер распределения аллелей и генотипов генов основных цитокинов у больных синдромом раздраженного кишечника с различными степенями дисбактериоза.
Материалы и методы. В исследование включен 81 больной СРК русской популяции. Пациенты находились на лечении в гастроэнтерологическом отделении Дорожной клинической больницы МПС на станции Челябинск в период с 2001 по 2007 гг. Диагноз СРК устанавливали в соответствии с Римскими критериями II (1999), III (2006) [4]. Средний возраст начала заболевания составил 32,8±1,4 лет, и длительность заболевания − от 3 до 10 лет. Обследование пациентов проводилось в соответствии Медико-экономическими стандартами Министерства Здравоохранения № 125 от 1998 г.
Контрольную группу представляли потенциальные доноры костного мозга ОГУП «Челябинская областная станция переливания крови»: 213 человек, из них мужчин – 119 (55,9%), женщин – 94 (44,1%). Средний возраст составил 34,6±0,75 года. Этническая принадлежность больных СРК и здоровых лиц определялась согласно рекомендациям Международного Уоркшопа (1980 г., Лос-Анджелес, США).
У 60 обследованных нами больных СРК при бактериологическом анализе кала был выявлен дисбактериоз толстой кишки неспецифичных изменений микрофлоры согласно отраслевому стандарту (ОСТ 91500.11.0004-2003) [5], данные приведены в таблице 1 [1].
Таблица 1.
Степень дисбактериоза |
Количество, n=60 |
Процент, % |
1 степень |
1 |
1,7 |
2 степень |
31 |
51,7 |
3 степень |
28 |
46,7 |
Для генотипирования индивидов использовали образцы тотальной ДНК, выделенной из цельной венозной крови. Генотипирование осуществляли путем прямой ПЦР-амплификации и ПДРФ-анализа – полиморфизм длин рестрикционных фрагментов, для детекции проводился горизонтальный и вертикальный электрофорез в 1,5% агарозном и 8% полиакриламидном геле. Характеристика исследуемых генов представлена в таблице 2 [2].
Таблица 2.
Характеристика исследуемых генов
ген |
полиморфизм |
Локализация в гене, характеристика |
IL-1Ra |
VNTR |
второй интрон: аллели c 2-х, 3-х, 4-мя, 5-ю и 6-ю кратными повторами |
IL-4 |
VNTR |
третий интрон: аллели с 2-кратным, 3-х кратным повтором |
IL-1β |
+3953 C/T |
5 экзон: рестрикционный сайт, эндонуклеаза рестрикции TaqI (65°); +3953* T: 550п.н. – редкий, +3953*C: 404, 146 п.н. - частый |
TNFα |
-863 C/A
-308 G/A
|
Промотор: TaiI(65°) -863*A:104;21 п.н. – редкий, -863*C:125п.н. –частый;
NcoI(37°) -308*A:126 п.н.– редкий,-308*G:104;22п.н. –частый;
|
Статистическая обработка. Анализ полученных данных проводился при одной степени свободы с использованием непараметрических критериев: критерии χ2, χ2 с поправкой Йетса (для одной степени свободы), точный двусторонний критерий Фишера, отношение шансов (OR) с расчетом 95% доверительного интервала (CI). Во всех случаях различия считали статистически значимыми при р≤0,05, незначимыми при р>0,10; для промежуточных значений р (0,05≤р≤ 0,10) обсуждали тенденцию к различиям.
Результаты и обсуждение
На первом этапе был проведен анализ распределения частот встречаемости аллелей и генотипов генов исследуемых цитокинов в группах больных СРК и условно-здоровых лиц русской популяции Челябинской области. Частоты встречаемости аллелей и генотипов генов IL-1Ra, IL-1b, IL-4, -308G/ATNFа не отличались между исследуемыми выборками.
Далее был проведен анализ распределения аллельных вариантов и генотипов генов IL-1Ra, IL-1b, IL-4, TNFaу больных СРК в зависимости от степени дисбактериоза. Данные представлены в таблице 3 [3].
Таблица 3.
Распределение аллелей и генотипов генов цитокинов у больных СРК в зависимости от степени дисбактериоза
аллель/ генотип |
2 степень |
3 степень |
достоверность
|
|||
IL-1RA |
n |
% |
n |
% |
||
2R |
16 |
25,8065 |
17 |
30,3571429 |
p= 0,6822 |
|
3R |
0 |
0 |
0 |
0 |
|
|
4R |
44 |
70,9677 |
39 |
69,6428571 |
p=1,0000 |
|
5R |
2 |
3,22581 |
0 |
0 |
p= 0,4970 |
|
2R/2R |
3 |
9,67742 |
4 |
14,2857143 |
p= 0,6978 |
|
4R/2R |
10 |
32,2581 |
9 |
32,1428571 |
p=1,0000 |
|
4R/4R |
16 |
51,6129 |
15 |
53,5714286 |
p=1,0000 |
|
4R/5R |
2 |
6,45161 |
0 |
0 |
p= 0,4927 |
|
IL1b |
|
|||||
Т |
15 |
24,1935 |
10 |
17,8571429 |
p= 0,5001 |
|
С |
47 |
75,8065 |
46 |
82,1428571 |
||
|
|
|
|
|
|
|
ТТ |
2 |
6,45161 |
0 |
0 |
p= 0,4927 |
|
СТ |
11 |
35,4839 |
10 |
35,7142857 |
p=1,0000 |
|
СС |
18 |
58,0645 |
18 |
64,2857143 |
p= 0,7899 |
|
-308 TNF |
|
|
|
|
|
|
A |
8 |
12,9032 |
14 |
25 |
p= 0,1034 |
|
G |
54 |
87,0968 |
42 |
75 |
||
|
|
|
|
|
|
|
A/A |
1 |
3,22581 |
1 |
3,57142857 |
p=1,0000 |
|
G/A |
6 |
19,3548 |
12 |
42,8571429 |
p= 0,0424 |
|
G/G |
24 |
77,4194 |
15 |
53,5714286 |
p= 0,0616 |
|
-863 TNF |
|
|
|
|
|
|
A |
7 |
11,2903 |
3 |
5,35714286 |
p= 0,3288 |
|
С |
55 |
88,7097 |
53 |
94,6428571 |
||
|
|
|
|
|
|
|
A/A |
0 |
|
0 |
0 |
|
|
С/A |
7 |
22,5806 |
3 |
10,7142857 |
p= 0,3056 |
|
С/С |
24 |
77,4194 |
25 |
89,2857143 |
||
IL-4 |
|
|
|
|
|
|
2r |
15 |
|
16 |
|
p= 0,6768 |
|
3r |
47 |
|
40 |
|
||
2r/2r |
3 |
9,67742 |
3 |
10,7142857 |
p=1,0000 |
|
3r/2r |
9 |
29,0323 |
10 |
35,7142857 |
p= 0,7808 |
|
3r/3r |
19 |
61,2903 |
15 |
53,5714286 |
p= 0,6048 |
Исходя из данных таблицы видно, что частоты встречаемости аллелей генов IL-1Ra, IL-1, IL-4, -308, -863 TNFα не различались между группами СРК с разными степенями дисбактериоза. Частоты встречаемости генотипов IL-1Ra, IL-1, IL-4, -863 TNFα также не имели статистически значимых различий между исследуемыми группами. Установлены статистически значимые изменения частот встречаемости генотипов SNP -308 TNFα: снижена частота гетерозиготного генотипа G/A, содержащего аллель гиперпродукции -308*А в группе со второй степенью микробиологических нарушений (19,4% vs 42,9%, р=0,04), на уровне тенденции повышена частота гомозиготного генотипа G/G (77,4% vs 53,6%, p=0,062). Однако по критерию отношения шансов, полученные различия оказались недостоверны: для генотипа G/A - 0,32 95% CI 0,097÷1,05; G/G – 2,97 95% CI 0,94÷9,35. Можно предположить, что носительство гетерозиготного генотипа G/A -308 TNFα способствует развитию глубоких микробиологических нарушений у больных СРК, в то время как в группе контроля лишь у 18% были установлены признаки дисбактериоза первой степени и не было достоверной взаимосвязи с встречаемостью аллелей и генотипов генов IL-1Ra, IL-1b, IL-4, -308G/ATNFа.
Анализ литературных данных указывает на связь между -308 полиморфизмом и тяжестью инфекционных болезней. Установлено, что некоторые инфекции, вызванные внутриклеточными возбудителями (лепра, лейшмания и хламидия), ассоциированы носительством G/A -308 TNFα организма-хозяина [6].
В то же время пока не ясно, какие именно мутации и каких цитокинов имеют решающее значение в развитии отдельных заболеваний. Вероятно, что большую роль играют не столько отдельные аллели генов, сколько их сочетания. Поэтому, перспективными направлениями молекулярно-генетических исследований являются изучение вкладов конкретных аллелей в подверженности к развитию патологии и инфицированию, расширение патогенетически важных количественных иммунологических признаков для оценки плейотропных эффектов анализируемых генов.
Выводы
1. Установлены статистически значимые изменения частот встречаемости генотипов SNP -308 TNFα: снижена частота гетерозиготного генотипа G/A, содержащего аллель гиперпродукции -308*А в группе со второй степенью микробиологических нарушений (19,4% vs 42,9%, р=0,04), на уровне тенденции повышена частота гомозиготного генотипа G/G (77,4% vs 53,6%, p=0,062).
2. Установлена взаимосвязь наличия гетерозиготного генотипа G/A -308 TNFαи клинически значимых микробиологических нарушений у больных синдромом раздраженного кишечника.
Литература
1. Бурмистрова А.Л. Ассоциация полиморфных генов цитокинов с клинико-морфологическими вариантами синдрома раздраженного кишечника / А.Л. Бурмистрова, Д.С. Сташкевич, Е.Л. Иванова, Т.А. Суслова // Вестник Уральской Медицинской Академической науки. – Екатеринбург, 2009. – № 2/1 (24). – С. 241-242.
2. Бурмистрова А.Л. Распределение аллелей и генотипов генов основных цитокинов у больных синдромом раздраженного кишечника / А.Л. Бурмистрова, Е.Л. Иванова, Д.С. Сташкевич, Т.А. Суслова // Аллергология и иммунология. – 2009. – Т. 10, № 2. – С. 262.
3. Ивашкин В.Т. Избранные лекции по гастроэнтерологии / В.Т. Ивашкин, А.А. Шептулин. – М.: МЕДпресс, 2001. – 88 с.
4. Маев И.В. Синдром раздраженного кишечника. Римские критерии III / И.В. Маев, С.В., Черемушкин // Гастроэнтерология. – 2008 – № 1. – С. 29-34.
5. Отраслевой стандарт ОСТ 91500.11.0004-2003 «Протокол ведения больных. Дисбактериоз кишечника» (утв. приказом Минздрава РФ от 9 июня 2003 г. № 231). – 94 С.
6. Grutters C. Increased Frequency of the Uncommon Tumor Necrosis Factor − 857T Allele in British and Dutch Patients with Sarcoidosis / C. Grutters, J.H. Sato et al. // The American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine. – Vol. 165. – 2002. – P. 1119-1124.
7. Oscar R.F. From cytokines to toll-like receptors and beyond - current knowledge and future research needs in irritable bowel syndrome / Oscar Rodriguez-Fandino, Joselin Hernandez-Ruiz, Max Schmulson // Journal of Neurogastroenterology and Motility. – Vol.16. – 2010. – P. 363-373.